أثار اغتيال سيف الإسلام القذافي تساؤلات حول طريقة تأمينه في مدينة الزنتان الليبية. ووفقًا للصحافي التيجاني خضر من شبكة العربية، لم تكن حماية سيف الإسلام مجرد إجراء أمني، بل كانت نتيجة علاقات اجتماعية وقبلية، حيث قامت كتيبة أبو بكر الصديق بقيادة العجم العتيري بتأمين القذافي منذ اعتقاله.
كما لعبت العادات القبلية الليبية دورًا في حماية المستجير، ورأى البعض في وجود سيف الإسلام فرصة للمصالحة الوطنية. بالإضافة إلى ذلك، كان يتمتع القذافي بنفوذ في مناطق الجبل الغربي، وسبها، والشويرف، وحظي بدعم من قبائل المقارحة ورفلة والجداتفه، ومجموعات الطوارق في الحمادة الحمراء.
غياب بيان من كتيبة أبو بكر الصديق حول ملابسات الحادث يثير مزيدًا من التساؤلات.
