أثار الاعتراف الإسرائيلي بصوماليلاند إشكاليات معقدة، بما في ذلك كسر الإجماع الدولي وتوتر العلاقات مع أفريقيا والعالم العربي. يرى محللون أن الخطوة قد تدخل إسرائيل في ملفات حساسة مثل سد النهضة وأمن البحر الأحمر، وتزيد من مخاطر التقسيم في الدول الهشة، بل وتحيي فكرة تهجير فلسطينيي غزة إلى أرض الصومال.
يناقش الخبراء دوافع نتنياهو وراء هذه الخطوة، وما إذا كانت تهدف إلى الضغط على الدول التي لم تدعم إسرائيل في حروبها الأخيرة، أم إلى تحقيق أهداف استراتيجية أوسع، بما في ذلك ترحيل الفلسطينيين من غزة. يشير البعض إلى أن كلفة الاعتراف بصوماليلاند قد تكون عالية على إسرائيل من الناحية الاستراتيجية.
