كشفت أسرة الشيخ صالح حنتوس عن تورط عبد الملك الحوثي شخصياً في جريمة اغتياله، متهماً الميليشيا الحوثية باستهداف الشيخ بسبب رفضه تدريس طلابه أفكارهم بدلاً من القرآن الكريم. وأفاد الكاتب الصحفي هشام المسوري، أحد أقارب الشيخ، بأن المشكلة بدأت بعد سيطرة الحوثيين على صنعاء، حيث سعوا للسيطرة على المؤسسات الدينية وتعليم القرآن، وإعادة تفسيره وفقاً لرؤيتهم.
كما أشار إلى أن الحوثيين اتهموا الشيخ بالتخابر مع العدو لإعاقة تحرير غزة.
